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深度測(cè)序揭示埃博拉病毒何以產(chǎn)生多樣性

2014-11-10 20:26:26
[導(dǎo)讀]最近,研究人員發(fā)現(xiàn),RNA編輯會(huì)導(dǎo)致埃博拉病毒的mRNA多樣性,但是這對(duì)病毒來說意味著什么呢?了解更多……

最近,研究人員發(fā)現(xiàn),RNA編輯會(huì)導(dǎo)致埃博拉病毒的mRNA多樣性,但是這對(duì)病毒來說意味著什么呢?了解更多……

  來自西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院、加爾維斯頓國(guó)家實(shí)驗(yàn)室和J. Craig Venter研究所的研究人員發(fā)現(xiàn),線狀病毒——包括埃博拉病毒和馬爾堡病毒,在感染期間,會(huì)產(chǎn)生比以前預(yù)計(jì)的范圍更廣的基因產(chǎn)物。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2014年11月4日的《mBio》,在這項(xiàng)研究中,本文資深作者、西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院的Christopher Basler發(fā)現(xiàn),在轉(zhuǎn)錄過程中病毒聚合酶會(huì)停滯在某些特定的基因組位置,并將額外的核苷酸添加到非經(jīng)典的病毒RNA編輯過程中。

  本文第一作者、J. Craig Venter 研究所助理教授Reed Shabman在一份新聞稿中這樣說道:“我們的研究表明,埃博拉病毒正在制造一些以前未描述的蛋白質(zhì)形式。”

  研究人員首次在一系列深度測(cè)序?qū)嶒?yàn)中,發(fā)現(xiàn)了這些修飾的病毒RNA,這些實(shí)驗(yàn)重點(diǎn)在于理解不同線狀病毒的轉(zhuǎn)錄、復(fù)制和病毒生命周期,包括引起當(dāng)前西非疫情的埃博拉病毒,和引起2005年安哥拉疾病爆發(fā)的相關(guān)馬爾堡病毒株。測(cè)序數(shù)據(jù)在這些病毒中揭示了一些以前未知的區(qū)域,這些區(qū)域的共轉(zhuǎn)錄(cotranscriptional)編輯可導(dǎo)致非模板編碼的殘基添加到一些病毒mRNA中,包括編碼糖蛋白、核蛋白和聚合酶的mRNA。

  我們知道,其他病毒聚合酶也在某些位置停滯,從而產(chǎn)生類似的非模板核苷酸添加物,但是這是第一次在絲狀病毒中確定這樣一種機(jī)制。有趣的是,當(dāng)作者研究了來自不同疫情爆發(fā)區(qū)的各種埃博拉病毒時(shí),他們發(fā)現(xiàn),非常規(guī)的編輯位點(diǎn),在不同病毒株之間是高度保守的。

  雖然在感染期間病毒產(chǎn)生的mRNA產(chǎn)物具有明顯擴(kuò)大的多樣性,但是這些修飾的RNA其所產(chǎn)生的影響和相關(guān)性尚不清楚。Basler說:“我們知道這些變化發(fā)生,但是我們不知道在病毒生物學(xué)中這意味著什么?!彼赋觯?yàn)閷?duì)于“病毒如何復(fù)制“我們還有很多不了解的方面。因此,我們需要對(duì)它們?nèi)绾纬砷L(zhǎng)有一個(gè)完整的描述,以開發(fā)新的策略來治療感染。

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