奧豪斯儀器(上海)有限公司在本文中利用奧豪斯PH計STARTER 3100/F對菌株的最適生長pH環(huán)境進行了測定。
1奧豪斯儀器分析菌株的篩選及形態(tài)學特征
經(jīng)過初篩和復篩從污泥土樣中篩選出了2株能以萘為唯一碳源進行生長的菌株,分 別 命 名 為XA1和XB1 這2株菌在LB固體培養(yǎng)基中培養(yǎng)初期均為乳白色菌落,在培養(yǎng)3d之后XA1和XB1的菌落顏色均轉(zhuǎn)變成淡黃色,且XA1的 菌 落 直 徑 為2.53.0mm,而XB1在相同的培養(yǎng)時間里菌落直徑只有12mm,2株菌的菌落特征均為圓形較透明,邊緣整齊,表面隆起濕潤光滑,易挑起 .在100倍油鏡下觀察均為長桿狀革蘭氏染色結(jié)果均為陰性.
2奧豪斯儀器上海有限公司對菌株系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建及菌種鑒定:將XA1XB1的16SrDNA序列通過Blast在NCBI上進行相似序列比對結(jié)果發(fā)現(xiàn),,XA1和XB1與Pseudomonassp.多個菌株的序列相似性均達到99% .對菌株的形態(tài)觀察及16SrDNA序列比對結(jié)果:可 以 確 定XA1和XB1皆屬于熒光假單胞菌Pseudomonasfluorescens.
3菌株的生理生化特性
3.1菌株生長曲線的測定XA1和XB1在LB培養(yǎng)基中96h的生長狀況,XA1在培養(yǎng)的前36h為對數(shù)生長期36 60h,為穩(wěn)定生長期60h,以后進入衰亡期XB1在培養(yǎng)的前32h,為對數(shù)生長期32 84h,為穩(wěn)定生長期84h之后,進入衰亡期.
3.2菌株最適生長溫度的測定: 對XA1和XB1在以萘500 mgL為 唯 一 碳 源 的 無 機 鹽 培 養(yǎng) 基,PH7.0(利用奧豪斯儀器(上海)有限公司生產(chǎn)的STARTER 3100/F型PH計測定)中于2837℃下的生長狀況進行觀測,結(jié)果顯示2株菌的最適生長溫度均為28℃, 在37℃下不能生長。
3·3 奧豪斯儀器(上海)有限公司利用奧豪斯PH計STARTER 3100/F對菌株最適生長pH的測定: 對XA1和XB1在不同pH值6.5、7.0、7.5、8.0、8.5以 萘500mg/L為唯一碳源的無機鹽MM培養(yǎng)基中,于28℃180rmin振蕩培養(yǎng),4d的生長狀況進行測定,結(jié)果顯示XA1的最適生長pH為7.5,XB1的最適生長pH為7.0。
3·4 菌株降解譜的測定 :分 別 以 萘菲聯(lián) 苯芴熒蒽苯并芘為唯一碳源測定菌株XA1XB1和模式菌株PseudomonasputidaKT2440于pH7.2(利用奧豪斯STARTER 3100/F酸度計測量),180rmin下培養(yǎng)10d的生長狀況。結(jié)果顯示XA1能以萘菲芴熒蒽為唯一碳源代謝XB1能以萘菲熒蒽及苯并芘為唯一碳源進行代謝XA1XB1的降解譜明顯比P.putidaKT24405菌株XA1XB1,對萘的降解特性, 將處于對數(shù)生長期的菌株按3%的接種量,接入萘質(zhì)量濃度為500mg/L的無機鹽液體培養(yǎng)基中28℃,180rmin下恒溫振蕩培養(yǎng),可知培養(yǎng)3d后菌株XA1對萘的降解率達到93.4% XB1對萘的降解率達到74.7%,菌株XA1XB1對萘的降解效果Fi g.6ThedegradationeffectofnaphthalenebyXA1and,XB16菌株XA1XB1降解途徑的研究, 將培養(yǎng)到對數(shù)期的XA1和XB1分別接種到50mL以水楊酸SA0.2gL和鄰苯二甲酸OA0.2gL為唯一碳源的無機鹽MM培養(yǎng)基中28℃180rmin恒溫振蕩培養(yǎng)結(jié)果,表明XA1和XB1皆存在水楊酸和鄰苯二甲酸2種代謝途徑且XA1和XB1都以水楊酸代謝途徑為主。
4 部分關(guān)鍵酶基因的PCR擴增與鑒定: 選取水楊酸代謝 途 徑 的 部 分 關(guān) 鍵 酶 基 因萘 雙 加 氧 酶nahAC 水 楊 醛 脫 氫 酶nahF 水 楊 酸 羥 化 酶nahG和兒茶酚23-雙加氧酶nahH 進行PCR擴增通過Blast比對結(jié)果,表明XA1具有nahACnahFnahH三個基因與文獻已報道的基因相似度均達到99% XB1具有nahAC和nahH兩 個 基 因與文獻已報道的基因相似度也達到99%,
可以初步確定XA1和XB1是以水楊酸途徑對萘進行降解的但2株菌中都沒有基因nahG存在證明其還是有別于已知的降解途徑。