探討超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)在高通量測(cè)序中應(yīng)用的最佳DNA片段化條件。方法 DNA樣品在冰浴條件下采用不同的超聲功率、單次間隙時(shí)間和超聲時(shí)間、工作時(shí)間(單一樣品超聲破碎時(shí)間)、儀器連續(xù)工作時(shí)間,通過瓊脂糖凝膠電泳和2100生物分析儀分別檢測(cè)基因組DNA片段化和羥甲基化免疫共沉淀效果。結(jié)果 超聲功率280W、間隙時(shí)間/超聲時(shí)間5s/5s、總工作時(shí)間18min,儀器連續(xù)工作時(shí)間不超過90min,超聲波處理時(shí)樣品始終保持冰浴環(huán)境可獲得高通量測(cè)序需要的、長(zhǎng)度主要集中在200~500bp之間的DNA片段。結(jié)論 在我們優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)條件下,利用超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)可以得到重復(fù)性較好的基因組DNA片段,可滿足高通量測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建中對(duì)DNA片段質(zhì)量的要求